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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111566496.5 (22)申请日 2021.12.20 (71)申请人 南京鼓楼医院 地址 210008 江苏省南京市中山路321号 (72)发明人 邹征云 秦岚群  (74)专利代理 机构 北京卓孚律师事务所 1 1821 代理人 谢梦欣 宋明 (51)Int.Cl. A61K 39/04(2006.01) A61P 35/00(2006.01) C07K 14/35(2006.01) (54)发明名称 通过分枝杆菌特异性免疫治疗肿瘤的方法 及使用的抗原肽 (57)摘要 本发明提供可被肿瘤细胞提呈的抗原肽在 治疗癌或肿瘤中的用途。 本发明提供通过抗原肽 激活特异性免疫(优选地, 结核分枝杆菌的预存 免疫)而治疗或预防癌症或肿瘤的方法, 及该方 法中使用的抗原肽, 及该抗原肽在制备癌症或肿 瘤的治疗药物中的用途。 通过预测与HLA  I类分 子分型亲和力筛选的一种或多种来源于结核分 枝杆菌与卡介苗共有的保护性抗原的抗原肽, 能 够激活受试者的预存免疫, 识别攻击肿瘤细胞, 治疗癌及肿瘤特别是实体瘤。 权利要求书1页 说明书22页 序列表3页 附图10页 CN 114404582 A 2022.04.29 CN 114404582 A 1.抗原肽 在制备用于治疗受试者中的癌症或肿瘤的药物中的用途, 所述抗原肽包含来自微生物的氨基酸序列并且与所述受试者的MHC分子的分型具有高 亲和性, 所述微生物为对人具有 免疫原性的微生物, 并且所述受试者的免疫系统对所述微生物 具有预存免疫。 2.根据权利要求1所述的用途, 其中所述 微生物为分枝杆菌属(Mycobacterium)细菌, 优选所述氨基酸序列来自牛分枝杆菌Ag85A蛋白(序列示于SEQ  ID No:3), 所述抗原肽 具有8~15个, 优选为8~10个氨基酸残基。 3.根据权利要求1或2所述的用途, 其中所述氨基酸序列为示于SEQ  ID No:1的氨基酸 序列G48V5 6, 或示于SEQ  ID No:2的氨基酸序列K242 V250。 4.癌症或肿瘤的治疗方法, 包括使用结核分枝杆菌或抗原肽激活罹患癌或肿瘤的受试 者的结核分枝杆菌特异性免疫, 其中, 所述抗原肽包含具有来自结核分枝杆菌的蛋白的氨基酸序列并与受试者的HLAI 类分子的分型 具有高亲和性。 5.根据权利要求4所述的方法, 其中, 当所述HLAI类分子的分型为HLA ‑A2, 更优选为 HLA‑A*02:01~ HLA‑A*02:06时, 所述抗原肽包含示于SEQ  ID No:1的氨基酸序列G48V 56, 或 示于SEQ ID No:2的氨基酸序列K242 V250。 6.分离的抗原肽, 其包含源自结核分枝杆菌属细菌的蛋白的氨基酸序列并与MHC分子 具有高亲和力, 所述氨基酸序列的长度为8~15个, 优选为8~10个氨基酸。 优选所述源自结核分枝杆菌属细菌的蛋白为Ag85A蛋白, 所述Ag85A蛋白具有SEQ  ID  NO:3所示的氨基酸序列。 7.根据权利要求6所述 的抗原肽, 其包含如SEQ  ID No:1或SEQ  ID NO:2所示 的氨基酸 序列, 或由SEQ  ID NO:1或SEQ  ID NO:2所示的氨基酸序列组成。 8.药物组合物, 其包 含上述分离的抗原肽, 优选所述分离的抗原肽以裸肽形式存在, 或为包含于多个抗原肽的含有酶切位点的融 合肽, 抗原肽 ‑抗体融合肽, 抗原肽 ‑接头‑抗体融合肽, 抗原肽 ‑纳米材料(优选为DSPE ‑PEG) 或纳米颗粒中的形式, 任选地, 所述药物组合物中包 含药学上可接受的载体。 9.卡介苗, 权利要求6或7的抗原肽, 或权利要求8的药物组合物在制备用于在受试者中 治疗或预防癌症的药物中的用途。 10.药物组合, 包 含权利要求6或7的抗原肽和另一种肿瘤治疗剂。权 利 要 求 书 1/1 页 2 CN 114404582 A 2通过分枝杆菌特异性免疫治疗肿瘤的方 法及使用的抗原肽 技术领域 [0001]本发明涉及肿瘤的免疫治疗领域。 本发明提供利用细胞免疫治疗肿瘤的方法, 及 所述方法中使用的抗原肽。 具体而言, 所述方法通过使用卡介苗或源自卡介苗的抗原肽激 活受试者体内的分枝杆菌特异 性免疫治疗肿瘤。 所述抗原肽来源于Ag8 5A蛋白, 并且能被肿 瘤细胞MHC分子有效呈递。 背景技术 [0002]近年来, 免疫治疗如T细胞治疗已成为癌症治疗领域一大治疗热点。 例如TCR ‑T、 CAR‑T等细胞治疗技术, 通过靶向肿瘤抗原, 分别在实体瘤和血液系统肿瘤中显示出强大的 治疗效果。 [0003]但是TCR‑T、 CAR‑T等细胞治疗的应用存在限制。 首先, 作为这些细胞疗法能够发挥 疗效的前提, 被治疗的实体肿瘤细胞必须高表达某种肿瘤特异性抗原, 且这种抗原在肿瘤 细胞上是有效呈递的。 其次, 由于肿瘤细胞的异质性, 不是所有的肿瘤细胞均 表达同一种抗 原, 限制了TCR ‑T、 CAR‑T等细胞治疗技术能够被应用的肿瘤(癌症)种类。 治疗性细胞的有效 送达率也成为问题。 [0004]此外, 肿瘤细胞的表面抗原表达缺失也限制了T细胞治疗的疗效。 抗原调变、 抗原 覆盖等现象的存在导致肿瘤细胞表面抗原表达缺失, 从而使此部分肿瘤细胞不受特定T细 胞的免疫监视, 造成免疫逃逸。 [0005]再者, 肿瘤抗原存在抗原呈递能力较差的问题。 肿瘤中存在各种抗原成分, 最广为 人知的抗原包括肿瘤相关抗原(Tumor ‑associated  antigen, TAA), 如癌胚抗原、 甲胎蛋白; 和肿瘤特异性抗原(Tumor ‑specific  antigen, TSA), 如MAGE ‑1和NY‑ESO‑1。 近年来, 新抗原 也逐渐进入肿瘤免疫治疗的视野, 显示出强大的治疗效果。 但上述抗原有一个共同的缺陷: 抗原的疏水性较强, 呈递能力弱, 即使新抗原也没能被有效呈递来发挥抗肿瘤作用。 因此, 需要能够被肿瘤分子有效提呈的新的抗原肽。 [0006]另一方面, 为了使上述细胞疗法发挥抗肿瘤作用, 还需要具有治疗能力的细胞能 穿透畸形复杂的肿瘤血管, 抵达肿瘤实质。 因此, 实际上能够到达病灶起效的细胞利用率也 成为问题。 因此, 过继性细胞治疗在实体肿瘤治疗中至今尚难以取得突破。 与此同时, 大部 分过继性细胞治疗研究尚处于临床试验阶段, 临床 操作程序复杂, 价格昂贵。 [0007]存在肿瘤中的被称为肿瘤浸润性淋巴细胞(tumor ‑infiltrating  lymphocyte, TIL)的免疫细胞, 与大多数类型癌症的更好治疗结果相关。 TIL中包括了肿 瘤抗原特异性T 细胞, 也包括很多非肿瘤抗原特异性T细胞。 所述非肿瘤抗原特异性T细胞可以包括例如细 菌/病毒抗原特异性的T细胞。 在TIL群体中, 表达细胞表面糖蛋白CD8的TIL被称为CD8+TIL, 它们能够发现癌细胞表面上的肿瘤抗原并将它们破坏。 因此, 许多免疫治疗策略旨在激活、 增强和维持这些细胞的癌症杀伤能力。 但 根据Evan  Newell等报道, 肺癌或结直肠癌患者的 肿瘤中, 大量的CD8+TIL细胞的特异性指向了与肿瘤无关的抗原, 仅一小部分CD8+TIL细胞 群体靶向的是突变相关 的癌症抗原。 换言之, 大量CD8+TIL细胞是对肿瘤熟视无睹的 “旁观说 明 书 1/22 页 3 CN 114404582 A 3

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专利 通过分枝杆菌特异性免疫治疗肿瘤的方法及使用的抗原肽 第 1 页 专利 通过分枝杆菌特异性免疫治疗肿瘤的方法及使用的抗原肽 第 2 页 专利 通过分枝杆菌特异性免疫治疗肿瘤的方法及使用的抗原肽 第 3 页
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