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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111230966.0 (22)申请日 2021.10.2 2 (71)申请人 赛业 (广州) 生物科技有限公司 地址 510663 广东省广州市高新 技术产业 开发区广州科学城国际企业孵化器孵 化楼 (D区) D314、 D315、 D316、 D317号 (72)发明人 沈超 刘华清 黄颖 韩蓝青 (74)专利代理 机构 广州嘉权专利商标事务所有 限公司 4 4205 代理人 郑宏谋 (51)Int.Cl. G16B 20/30(2019.01) G16B 20/50(2019.01) G16H 50/30(2018.01) G06N 20/00(2019.01)G06N 3/08(2006.01) (54)发明名称 一种疾病预测方法、 系统、 计算机设备及介 质 (57)摘要 本发明提供的一种疾病预测方法、 系统、 计 算机设备 以及介质, 其方法包括以下步骤: 获取 染色体的突变位点信息; 根据所述突变位点信息 从染色体数据库中提取得到数据特征, 对所述特 征数据进行二值化处理得到致病性预测特征; 将 所述致病性预测特征输入至预先生成的疾病预 测模型, 输出得到致病性数据; 根据所述致病性 数据得到致病性预测结果; 方案融合生物知 识和 统计学知识, 极大程度的对突变点信息与目标疾 病之间的关系进行挖掘, 有利于提高疾病预测的 准确度, 并且适用性更强且扩展性能更强, 能够 为医患提供判断某个突变位点致病性的准确参 考, 可广泛应用于生物信息技 术领域。 权利要求书2页 说明书8页 附图2页 CN 113889188 A 2022.01.04 CN 113889188 A 1.一种疾病预测方法, 其特 征在于, 包括以下步骤: 获取染色体的突变位 点信息; 根据所述突变位点信 息从染色体数据库中提取得到数据 特征, 对所述特征数据进行二 值化处理得到致病性预测特 征; 将所述致病性预测特 征输入至预 先生成的疾病预测模型, 输出 得到致病性数据; 根据所述 致病性数据得到致病性预测结果。 2.根据权利要求1所述的一种 疾病预测方法, 其特征在于, 在对所述特征数据进行二值 化处理得到致病性预测特征之前, 所述疾病 预测方法还包括以下步骤至少之一: 去除所述 特征数据中与致病性预测不相关的数据; 对所述特 征数据中的缺失值进行填充。 3.根据权利要求1所述的一种 疾病预测方法, 其特征在于, 所述将所述致病性预测特征 输入至预 先生成的疾病预测模型这 一步骤之前, 所述疾病预测方法还 包括: 从基因突变致病数据库中获取若干数据形成第一数据集; 对所述第一数据集进行预处理, 构建特征工程从预处理后的所述第 一数据集筛选得到 训练数据集和 测试数据集; 通过所述训练数据集对所述疾病预测模型训练, 通过所述测试数据集对训练后的所述 疾病预测模型进行调参。 4.根据权利要求3所述的一种 疾病预测方法, 其特征在于, 所述构建特征工程从预处理 后的所述第一数据集筛 选得到训练数据集和 测试数据集, 包括以下步骤: 根据预设的质量 值阈值以及可信度阈值对所述第一数据进行 数据清洗; 对数据清洗后的所述第一数据集中存在缺失值的数据进行补全; 对补全缺失值后的所述第 一数据集进行二值化处理, 并将二值化后的数据划分得到所 述训练数据集和所述测试 数据集。 5.根据权利要求4所述的一种 疾病预测方法, 其特征在于, 在所述对数据清洗后的所述 第一数据集中存在缺失值的数据进行补全之后, 所述疾病预测方法还 包括以下步骤: 对清洗后的所述第 一数据进行标签标注, 区分得到包含致病突变点位的第 二数据以及 包含良性突变位点的第三数据。 6.根据权利要求1所述的一种 疾病预测方法, 其特征在于, 所述根据所述致病性数据得 到致病性预测结果 这一步骤, 包括: 通过混淆矩阵以及接受者操作特性曲线确定致病概 率区间; 根据所述 致病性数据与所述 致病概率区间得到所述 致病性预测结果。 7.根据权利要求1所述的一种 疾病预测方法, 其特征在于, 所述根据所述突变位点信 息 从染色体数据库中提取 得到数据特 征这一步骤, 包括 根据所述 突变位点信息生成索引指标, 通过全基因 组对比得到目标基因信息; 根据突变位点上下游的碱基信 息得到鸟嘌呤和胞嘧啶所占的比率, 以及所述目标基因 信息匹配得到表 观遗传特 征作为所述数据特 征。 8.一种疾病预测系统, 其特 征在于, 包括: 信息获取模块, 用于获取染色体的突变位 点信息; 数据处理模块, 用于根据所述突变位点信息从染色体数据库中提取得到数据特征, 对权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 113889188 A 2所述特征数据进行二 值化处理得到致病性预测特 征; 模型预测模块, 用于将所述致病性预测特征输入至预先生成的疾病预测模型, 输出得 到致病性数据; 并根据所述 致病性数据得到致病性预测结果; 数据存储模块, 用于存 储染色体信息 。 9.一种疾病预测计算机设备, 其特 征在于, 包括: 至少一个处 理器; 至少一个存储器, 用于存储至少一个程序; 当所述至少一个程序被所述至少一个处理 器执行, 使得所述至少一个处 理器运行如权利要求1 ‑7任一项所述方法。 10.一种存储介质, 其中存储有处理器可执行的程序, 其特征在于, 所述处理器可执行 的程序在由处 理器执行时用于运行如权利要求1 ‑7中任一项所述 一种疾病预测方法。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 113889188 A 3
专利 一种疾病预测方法、系统、计算机设备及介质
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