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书书书犐 犆 犛1 1.0 2 0犆6 2 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 犛 犖/犜5 1 0 5—2 0 1 9 国境口岸轮状病毒 (犅组)实时荧光犚 犜  犘 犆 犚 检测方法 犇 犲 狋 犲 犮 狋 犻 狅 狀犿 犲 狋 犺 狅 犱狅 犳犚 狅 狋 犪 狏 犻 狉 狌 狊 (犵狉 狅 狌狆犅)犫狔狉 犲 犪 犾  狋 犻 犿 犲犳 犾 狌 狅 狉 犲 狊 犮 犲 狀 犮 犲犚 犜  犘 犆 犚犪 狋 犳 狉 狅 狀 狋 犻 犲 狉 狆狅 狉 狋 狊 2 0 1 90 90 3发布 2 0 2 00 30 1实施 中华人民共和国海关总署 发 布 rHgCb@g · ykbûR60u5[PO –0SÑU.书书书前  言   本标准按照 G B/T1. 1—2 0 0 9给出的规则起草 。本标准由中华人民共和国海关总署提出并归口 。本标准起草单位 :中华人民共和国拱北海关 、中华人民共和国厦门海关 、中华人民共和国深圳海关 、深圳市计量质量检测研究院 。本标准主要起草人 :莫秋华、杨坤宇、杨泽、汪海波、史蕾、陈晶、陈新彬、吴锦顺、涂承宁、史咏梅、杨国武。 Ⅰ犛 犖/犜5 1 0 5—2 0 1 9 rHgCb@g · ykbûR60u5[PO –0SÑU.国境口岸轮状病毒 (犅组)实时荧光犚 犜  犘 犆 犚 检测方法 1 范围 本标准规定了国境口岸成人腹泻轮状病毒 (B组)实时荧光 RT  P C R 检测的对象 、检测方法及结果报告。本标准适用于国境口岸成人腹泻轮状病毒 (B组)的实验室检测 。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的 。凡是注日期的引用文件 ,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件 ,其最新版本 (包括所有的修改单 )适用于本文件 。 G B1 9 4 8 9  实验室 生物安全通用要求 S N/T1 7 2 0 出入境口岸轮状病毒感染监测规程 WS/T2 3 0 临床诊断中聚合酶链反应 (P C R)技术的应用人间传染的病原微生物名录 (原中华人民共和国卫生部 ) 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件 。 3.1轮状病毒  狉 狅 狋 犪 狏 犻 狉 狌 狊属于呼肠孤病毒科 (犚 犲 狅 狏 犻 狉 犻 犱 犪 犲 )轮状病毒属 (犚 狅 狋 犪 狏 犻 狉 狌 狊 ) ,为双链RNA病毒,基因组分 1 1个节段,是引起人类 、哺乳动物类和鸟类腹泻的主要病原体 。轮状病毒有 7个血清组 (A~G) ,其中A、B、C组能引起人和动物腹泻 。A组轮状病毒最常见 ,它是婴幼儿腹泻首要的致病原 。B组轮状病毒感染对象没有年龄限制 ,主要感染 1 5—4 5岁的青壮年 ,但也可感染老人和婴幼儿 ,故又定名为成人腹泻轮状病毒 (a d u l td i a r r h e ar o t a v i r u s ,ADRV) 。 3.2 逆转录聚合酶链反应  狉 犲 狏 犲 狉 狊 犲狋 狉 犪 狀 狊 犮 狉 犻 狆狋 犻 狅 狀狆狅 犾狔犿 犲 狉 犪 狊 犲犮 犺 犪 犻 狀狉 犲 犪 犮 狋 犻 狅 狀 ;犚 犜  犘 犆 犚将RNA的逆转录 (RT)和c DNA的聚合酶链式扩增 (P C R)相结合的技术 。本标准采用一步法逆 转录聚合酶链式反应 (RT  P C R ) 。在一步法 RT  P C R 中,首先以RNA为模板,利用下游特异性引物 , 在依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶 )的作用下转录合成互补 DNA(c DNA) ,该步称作 “逆转录” :随 后,再以c DNA为模板,利用上游和下游特异性引物 ,在DNA聚合酶的作用下进行 P C R循环扩增 ;最 终使RNA分子的某个特定区域 (目的片段 )被扩增达几百万倍 。 3.3 实时荧光 犚 犜  犘 犆 犚  狉 犲 犪 犾  狋 犻 犿 犲犳 犾 狌 狅 狉 犲 狊 犮 犲 狀 犮 犲犚 犜  犘 犆 犚通过荧光染料或荧光标记的特异性荧光探针 ,对反转录后 P C R扩增的产物进行标记跟踪 ,利用荧 光信号累积实现实时在线监测整个 P C R反应过程 ,结合相应的软件可以对结果进行定性和定量分析 。 1犛 犖/犜5 1 0 5—2 0 1 9 rHgCb@g · ykbûR60u5[PO –0SÑU.本标准所采用的荧光探针是分子信标 (m o l e c u l a rb e a c o n )探针。分子信标探针是一种荧光标记的寡核 苷酸链,一般含有 2 5~3 5个核苷酸 。在结构上 ,分子信标探针可以分为三部分 ,即环状区 、茎干区、荧光 基团和淬灭基团 。环状区:一般由1 5~3 0个核苷酸组成 ,可以与靶分子特异结合 ;茎干区:寡核苷酸链 两端的核酸序列互补配对形成的 5~8个碱基对的 DNA双链结构 ,在分子信标与靶分子结合过程中可 发生可逆性解离 ;荧光基团和淬灭基团 :荧光报告基团 (如F AM)一般连接在 5’端,荧光淬灭基团 (如 D a b cyl)一般连接在 3’端。自由状态时的分子信标呈发夹结构 ,此时由于荧光基团与淬灭基团靠得很 近,荧光被淬灭 ;当与靶序列结合后 ,分子信标的空间构型发生改变 ,使荧光基团与淬灭基团距离变大 , 分别位于伸展开的探针的两端 ,荧光得以恢复 。分子信标技术具有很高的特异性 ,而且操作简便 、灵敏 度高,特别是它可以进行实时定量检测 ,甚至可以用于活体分析 。 3.4 犆 狋值 犆狔犮 犾 犲狋 犺 狉 犲 狊 犺 狅 犾 犱在荧光P C R中,每个反应管内的荧光信号到达设定的阈值时所经历的循环数 。 4 缩略语 下列缩略语适用于本文件 。 D E P C:焦碳酸乙二酯 (d i e t hylp yr o c a r b o n a t e ) P AG E:聚丙烯酰胺凝胶电泳 (po lya c ryl a m i d ege le l e c t r o ph o r e s i s) HP L C:高效液相色谱 (h ighpe r f o r m a n c el i qu i dc h r o m a t o gr aphy) bp:碱基对(b a s epa i r) F AM:6 羧基一荧光素 (6  c a r b o x y f l u o r e s c e i n ) DA B C YL :4,4 二甲氨基 偶氮苯 4’羧酸(4,4  d i m e t h yl a m i n o  a z o b e n z e n e  4 ′  c a r b o x yl i ca c i d) 5 检测对象 5.1 国境口岸发现的有呕吐 、腹泻和发热等症状 ,疑似腹泻病毒感染的急性肠胃炎病人 。 5.2 其他申请检验的人员 。 6 生物安全和 犘 犆 犚防污染要求 实验室生物安全应符合 G B1 9 4 8 9 和《人间传染的病原微生物名录 》的规定。P C R防污染措施按 WS/T2 3 0的规定执行 。 7 主要仪器 主要仪器设备如下 : — — —二级B型生物安全柜 ; — — —台式高速冷冻离心机 (最高离心力 1 20 0 0× g以上) ; — — —旋涡振荡器 ; — — —冰箱:4℃、-2 0℃和-7 0℃; — — —超净工作台 ; 2犛 犖/犜5 1 0 5—2 0 1 9 rHgCb@g · ykbûR60u5[PO –0SÑU.— — —微型离心机 ; — — —荧光定量 P C R仪; — — —电子天平 (d=1mg) ; — — —微波炉; — — —电泳仪; — — —高压灭菌锅 ; — — —超纯水器或双蒸水器 ; — — —微量可调移液器一套 (含以下5种规格:1 0μL、2 0μL、1 0 0μL、2 0 0μL、1mL) 。 8 主要试剂 8.1 无RNA酶的D E P C水。 8.2 引物和探针 :RT  P C R 引物应为 P AG E以上级别纯化 ,探针为 HP L C纯化,引物和探针序列见9. 2. 3. 1。 8.3 一步法荧光 RT  P C R 基础试剂 :宝生物工程 (大连)有限公司 O n eS t epP r i m e S c r i pTMRT  P C RK i t(P e r f e c tR e a lT i m e )1)。 1) 给出这一信息是为了方便本标准的使用者 ,并不表示对该产品的认可和推荐 。如果其他等效产品具有相同的 效果,则可使用这些等效产品 。9 检验程序 9.1 样品采集 粪便标本和呕吐物标本的采集按照 S N/T1 7 2 0执行。 9.2 实验室检验 9.2.1 样品处理 取黄豆大小约 1 0 0mg~2 0 0mg的粪便标本或呕吐物 ,或1 0 0μL~2 0 0μL水样便,加入8 0 0μL的生理盐水 ,剧烈振荡混匀 ,制成1 0%~2 0%的悬液:然后4℃,80 0 0×g离心5m i n;转移上清至灭菌的干净离心管 。不能立即进行检测时 ,样本冻存于 -7 0℃超低温冰箱备用 。 9.2.2 病毒核酸提取 9.2.2.1 犜 狉 犻 狕 狅 犾法 取处理好的样本 1 5 0μL,加入7 5 0μLT r i z o l 液,振荡混匀后室温静置 5m i n,然后加入 2 0 0μL三氯甲烷,盖紧离心管 ,振荡混匀 1 5s后室温静置 5m i n,4℃,1 20 0 0× g离心1 0m i n,取上层水相至另一离

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