(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111533637.3 (22)申请日 2021.12.15 (71)申请人 中国人民解 放军军事科学院军事医 学研究院 地址 100850 北京市海淀区太平路27号 申请人 中国人民解 放军总医院第五医学中 心 (72)发明人 刘巧维　许周暘　王李杰　李瑶　 黄迪　胡毅　 (74)专利代理 机构 北京领科知识产权代理事务 所(特殊普通 合伙) 11690 代理人 杨晞　张丹 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) G01N 33/574(2006.01)G16B 15/20(2019.01) G16B 15/30(2019.01) G16H 70/40(2018.01) A61K 45/00(2006.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 一种鳞癌的预后标志物、 预后风险评估模 型 的建立方法及其应用 (57)摘要 本发明公开了一种鳞癌的预后标志物、 预后 风险评估模 型的建立方法及其应用， 与现有技术 中鳞癌单一基因表达检测相比， 本发 明具有更高 的特异性和更高的诊断效能， 可显著提高检测敏 感度及特异度， 本发明能够准确、 便捷、 高效地为 鳞癌患者提供有效治疗措施并改善预后， 本发明 具有良好的临床应用价值， 具有敏感性高、 特异 性好、 准确率高的优点， 可为临床医师对鳞癌患 者的治疗决策提供有效的指导意见， 减少无效治 疗的发生， 从而降低患者的治疗成本和不适体 验， 能够改善鳞癌患者的远期预后， 以期缓解社 会疾病负担 。 权利要求书2页 说明书15页 附图3页 CN 114164273 A 2022.03.11 CN 114164273 A 1.一种鳞癌的预后标志物， 其特征在于， 所述的预后标志物包括组合基因， 所述的组合 基因包括如下基因： ZFP42基因， M ME基因， FIGN基因， M YBPH基因和KCNH1基因。 2.基因组合作为预后标志物在制备用于评估鳞癌预后 风险的产品中的应用， 其特征在 于， 所述评估鳞癌预后风险的产品包括检测组合基因的mRNA表达水平或 蛋白表达水平的产 品， 所述的基因组合包括如下基因： ZFP42基因， MME基因， FIGN基因， MYBPH基因和KCNH1基 因； 所述的评估鳞癌预后风险包括以下步骤： (1)数据收集和处 理 从UCSC Xena数据库、 TCGA数据库和GEO数据库获取鳞癌患者的基因数据和临床数据， 并对数据进行 预处理； (2)筛选差异表达基因 对步骤(1)中的基因进行识别， 通过符合选择 标准的R筛 选出差异 表达的基因； (3)生存分析 对步骤(2)中得到的差异表达基因取交集后通过R软件 “survival ”包进行单因素Cox分 析， 识别出生存相关基因； (4)预后风险评估 模型的开发 对步骤(3)所述的生存相关基因， 采用多元Cox回归方法， 建立了预后风险评估模型， 所 述模型用于评估鳞癌预后风险指数， 风险指数的计算公式为： 风险评分＝0.05 ×ZFP42+ 0.085×MME+0.08×MYBPH+0.023 ×FIGN–0.01×KCNH1； (5)在测试集上验证模型 是否构建成功 根据步骤(4)所得的预后风险评估模型计算GEO数据集的风险评分， 并将其分为高危组 和低危组， 对两组进行生存分析； (6)验证模型 是否适用于所有类型的鳞癌。 3.如权利 要求2所述的应用， 其特征在于， 所述风险评分高于 ‑1.89时为 高风险； 所述风 险评分低于 ‑1.89时为低风险。 4.权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述检测组合基因的mRNA表达水平或蛋白表达 水平的产品包括能够结合组合基因的核酸或能够结合组合基因所表达的蛋白的物质。 5.权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述产品选自： 试剂、 试剂盒、 试纸、 基因芯片、 高通量测序平台、 抗体芯片、 仪器平台； 优选地， 所述仪器平台包含测量模块， 用于测量待测样本中组合基因所表达的蛋白的 含量。 6.权利要求2所述的应用， 其特征在于， 所述鳞癌包括肺磷癌、 头颈部鳞癌、 食管磷癌、 宫颈磷癌和阴道磷癌； 优选为肺磷癌、 头 颈部鳞癌、 食管磷癌和宫颈磷癌。 7.权利要求2所述的应用， 其特征在于， 用于所述检测组合基因mRNA表达水平或蛋白表 达水平的检测样本为受试者的组织样品或流体， 优选为肿瘤组织、 肿瘤细胞、 血液、 血浆和 血清中的一种。 8.一种鳞癌的预后风险评估模型的建立方法， 其特征在于， 所述的风险评估模型采用 如权利要求1所述的预后标志 物进行预测； 所述的建立方法包括以下步骤： (1)数据收集和处 理 从UCSC Xena数据库、 TCGA数据库和GEO数据库获取鳞癌患者的基因数据和临床数据，权　利　要　求　书 1/2 页 2 CN 114164273 A 2并对数据进行 预处理； (2)筛选差异表达基因 对步骤(1)中的基因进行识别， 通过符合选择 标准的R筛 选出差异 表达的基因； (3)生存分析 对步骤(2)中得到的差异表达基因取交集后通过R软件 “survival ”包进行单因素Cox分 析， 识别出生存相关基因； (4)预后风险评估 模型的开发 对步骤(3)所述的生存相关基因， 采用多元Cox回归方法， 建立了预后风险评估模型， 所 述模型用于评估鳞癌预后风险指数， 风险指数的计算公式为： 风险评分＝0.05 ×ZFP42+ 0.085×MME+0.08×MYBPH+0.023 ×FIGN–0.01×KCNH1； (5)在测试集上验证模型 是否构建成功 根据步骤(4)所得的预后风险评估模型计算GEO数据集的风险评分， 并将其分为高危组 和低危组， 对两组进行生存分析； (6)验证模型 是否适用于所有类型的鳞癌。 9.如权利要求8所述的预后 风险评估模型的建立方法， 其特征在于， 所述模型的方程式 为： 风险评分＝0.0 5×ZFP42+0.085 ×MME+0.08×MYBPH+0.023 ×FIGN–0.01×KCNH1。 10.如权利要求9所述的预后风险评估模型的建立方法， 其特征在于， 所述风险评分高 于‑1.89时为高风险； 所述 风险评分低于 ‑1.89时为低风险。 11.一种如权利要求1所述的预后标志物在制备鳞癌预后诊断试剂和/或鳞癌治疗药物 中的应用。权　利　要　求　书 2/2 页 3 CN 114164273 A 3