(19)国家知识产权局
(12)发明 专利申请
(10)申请公布号
(43)申请公布日
(21)申请 号 202210390708.7
(22)申请日 2022.04.14
(71)申请人 电子科技大 学
地址 611731 四川省成 都市高新区 (西区)
西源大道 2006号
(72)发明人 高婧婧 王正宁 彭大伟 吴岳潼
商勇彬 徐宇航
(74)专利代理 机构 电子科技大 学专利中心
51203
专利代理师 曾磊
(51)Int.Cl.
G06V 10/764(2022.01)
G06V 10/762(2022.01)
G06V 10/80(2022.01)
G06V 10/82(2022.01)G06K 9/62(2022.01)
G06N 3/04(2006.01)
G06N 3/08(2006.01)
(54)发明名称
基于图神经网络和自注意力的磁共振影像
辅助处理系统
(57)摘要
本发明公开了一种基于图神经网络和自注
意力的磁共振影像辅助处理系统, 包括依次连接
的MRI数据预处理模块和若干个基于自注 意力的
长短距离特征融合图神经网络SALS ‑GNN, 每个
SALS‑GNN包括依次连接的自注意力特征提取模
块和特征融合模块, 每一个自注 意力特征提取模
块由多个并联的基于多头自注意力的不同距离
的特征提取子网络SA组成。 本发明通过把大脑的
网络图结构纳入考量范围, 并以此构建相应的数
据和模型; 通过优化设计图神经网络模型, 基于
自注意力机制, 综合考虑脑网络结构的长短距离
依赖, 提取大脑的全局和局部特征, 并进行特征
融合, 显著提高了神经网络的特征提取能力和分
类性能。
权利要求书3页 说明书9页 附图2页
CN 114743053 A
2022.07.12
CN 114743053 A
1.一种基于 图神经网络和自注意力的磁共振影像辅助处理系统, 其特征在于, 该系统
包括依次连接的MRI数据预处理模块和L个相同的基于自注意力的长短距离特征融合图神
经网络SALS ‑GNN, 其中L为大于或等于1的整数; 与MRI数据预处理模块直接相连的SALS ‑GNN
称为第1个SALS ‑GNN, 后续依次表示为第2个、 第3个、 直至第L个SALS ‑GNN, 其中, 每个基于自
注意力的长 短距离特征融合图神经网络SA LS‑GNN包括依次连接的1个自注 意力特征提取模
块和1个特征融合模块, 第l个SALS ‑GNN的自注意力特征提取模块与第l ‑1个SALS‑GNN的特
征融合模块相连, l=2,3,...,L; 每一个自注 意力特征提取模块由M个并联的基于多头自注
意力的不同距离的特征提取子网络SA组成, 每个特征提取子网络SA由H头自注意力模型构
成; L个SALS ‑GNN的自注意力特征提取模块结构相同、 但模型参数不同, 并且L个SALS ‑GNN的
特征融合模块结构相同、 但模型参数不同; 所有H 头自注意力模型 结构和参数均相同;
所述MRI数据预处理模块, 输入核磁共振成像仪采集的MRI影像, 并将采集的MRI影像预
处理后, 输出 大脑图结构数据, 具体包括:
S11)通过核磁共振成像仪采集大脑的MRI影像, 使用标准脑模板对采集的每一幅大脑
的MRI影像进行脑区划分;
S12)将进行脑区划分后的每一幅大脑的MRI影像通过预处理得到一个原始图数据G0=
(N,E,F0), 其中G0为有向图, N 为节点集合, E为边集合, F0为节点特 征集合;
对于SALS ‑GNN中的自注意力特征提取模块, 除第1个SALS ‑GNN以外的任意一个SALS ‑
GNN中的自注 意力特征提取模块, 输入为上一个SALS ‑GNN中特征融合模块的输出图数据, 对
于第1个SA LS‑GNN中的自注 意力特征提取模块, 输入为MRI数据预处理模块得到的原始图数
据G0, 各SALS‑GNN用于获取大脑脑区间的长短距离依赖, 对脑区进行不同距离的特征提取,
输出不同距离的大脑特 征, 这L个SALS‑GNN的工作过程具体为:
S21)将原始图数据G0=(N,E,F0)输入第1个SALS ‑GNN中的自注意力特征提取模块, 在第
l个SALS‑GNN的自注意力特征提取模块中, 输入数据为第l ‑1个SALS‑GNN的特征融合模块的
输出图数据 Gl‑1=(N,E,Fl‑1), 每一个图数据的节点集合N和边集合E都不会被更新, 由图数
据Gl‑1中N个节点特征
构成的特征矩阵
将会被更新, 其中,
Rf表示长度为f的向量, f为预处 理参数, n =0,1,...,N‑1;
S22)图数据Gl‑1=(N,E,Fl‑1)输入M个并联的基于多头自注意力的不同距离的特征提取
子网络SA, 每个特征提取子网络SA都具有相同的信息传递流程, 以路径长度m表示第 m个特
征提取子网络SA提取 特征的距离, 第m个特 征提取子网络SA被命名为SA ‑m, m=1,2,. ..,M;
S23)任意一个子网络SA ‑m对有向图Gl‑1中的每个节点进行距离为m的特征提取, 对任意
一个节点Nj, j=0,1,...,N ‑1进行特征提取时, 选择距离d(Ni,Nj)=m的点集{Ni}的特征, 通
过第l‑1个SALS‑GNN的自注意力特征提取模块中的H头自注意力模型进行聚合, 其中i≠j,
i,j=0,1,. ..,N‑1;
S24)在H头自注意力模型的任意第h个抽头中, h=1,2,...,H, 每个节点的特征
通过公式 (1)的三个线性层获得对应的向量
其中
是三个不同的权重矩阵,
是与之对应的三个不同
的偏置矩阵;权 利 要 求 书 1/3 页
2
CN 114743053 A
2S25)获得所有节点的向量
后, 将S23)得到的距离d(Ni,Nj)=m的点
集{Ni}, 通过公式(2)的自注意力模型, 聚合得到节点 Nj的特征
其中, epq表示有向图Gl‑1中边NpNq的权重, p,q=0,1,...,N ‑1, 这里节点Np和Nq是相邻
的, 所以满足d(Np,Nq)=1; 距离d(Ni,Nj)=m的路径NiNj间的权重为构成路径NiNj的所有边的
权重的连乘; dK表示
的维度; Softmax( ·)为归一化指数函数; Π表示连乘符号, 上标T
表示向量的转置; Ni∈N{d(Ni,Nj)=m,i≠j}表示节点Ni到Nj距离为m的所有节点的集合, 且i
≠j; NpNq∈NiNj表示边NpNq是路径NiNj中的一条边;
是一个中间变量; eji表示节点Ni到
Nj的权值;
S26)将S25)得到的H个抽头特征
按式(3)进行融合, 得到SA ‑m输出节点Nj的特征
其中Concat(·)表示为矩阵拼接;
对于SALS ‑GNN中的特征融合模块, 输入位于同一个SALS ‑GNN中的自注意力特征提取模
块获得的特 征, 通过融合, 更新大脑 脑区的特 征表达, 输出融合后的特 征, 具体包括:
S31)原始图数据G0的节点集合N的特征矩阵为
将M个特征提取
子网络SA分别 得到的特征Fl,m一起输入一个特征融合模块, 通过公式(4)进行特征融合, 得
到第l个SALS ‑GNN的输出特征Fl; Fusion(·)表示特征融合模型;
Fl=Fusion(Fl,1,Fl,2,...,Fl,M) (4)
S32)通过L个自注意力特征提取模块和特征融合模块的级联, 构建深度为L的基于图神
经网络和自注意力的磁共 振影像辅助处 理系统, 基于该系统得到如下 结果:
1)获得L×M×H个注意力图αl,m,h, 注意力图进行可视化得到热力图, 即可视化结果1, 热
力图反映任意网络层l在距离为m进行 特征聚合时, 脑区间的侧重倾向;
2)通过在可视化结果1中同一网络层l, 不同聚合距离m的热力图, 得到特征信息在不同
距离间的传递特性, 获得不同距离的脑区依赖关系;权 利 要 求 书 2/3 页
3
CN 114743053 A
3
专利 基于图神经网络和自注意力的磁共振影像辅助处理系统
文档预览
中文文档
15 页
50 下载
1000 浏览
0 评论
309 收藏
3.0分
温馨提示:本文档共15页,可预览 3 页,如浏览全部内容或当前文档出现乱码,可开通会员下载原始文档
本文档由 人生无常 于 2024-03-18 07:37:16上传分享