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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210390708.7 (22)申请日 2022.04.14 (71)申请人 电子科技大 学 地址 611731 四川省成 都市高新区 (西区) 西源大道 2006号 (72)发明人 高婧婧 王正宁 彭大伟 吴岳潼  商勇彬 徐宇航  (74)专利代理 机构 电子科技大 学专利中心 51203 专利代理师 曾磊 (51)Int.Cl. G06V 10/764(2022.01) G06V 10/762(2022.01) G06V 10/80(2022.01) G06V 10/82(2022.01)G06K 9/62(2022.01) G06N 3/04(2006.01) G06N 3/08(2006.01) (54)发明名称 基于图神经网络和自注意力的磁共振影像 辅助处理系统 (57)摘要 本发明公开了一种基于图神经网络和自注 意力的磁共振影像辅助处理系统, 包括依次连接 的MRI数据预处理模块和若干个基于自注 意力的 长短距离特征融合图神经网络SALS ‑GNN, 每个 SALS‑GNN包括依次连接的自注意力特征提取模 块和特征融合模块, 每一个自注 意力特征提取模 块由多个并联的基于多头自注意力的不同距离 的特征提取子网络SA组成。 本发明通过把大脑的 网络图结构纳入考量范围, 并以此构建相应的数 据和模型; 通过优化设计图神经网络模型, 基于 自注意力机制, 综合考虑脑网络结构的长短距离 依赖, 提取大脑的全局和局部特征, 并进行特征 融合, 显著提高了神经网络的特征提取能力和分 类性能。 权利要求书3页 说明书9页 附图2页 CN 114743053 A 2022.07.12 CN 114743053 A 1.一种基于 图神经网络和自注意力的磁共振影像辅助处理系统, 其特征在于, 该系统 包括依次连接的MRI数据预处理模块和L个相同的基于自注意力的长短距离特征融合图神 经网络SALS ‑GNN, 其中L为大于或等于1的整数; 与MRI数据预处理模块直接相连的SALS ‑GNN 称为第1个SALS ‑GNN, 后续依次表示为第2个、 第3个、 直至第L个SALS ‑GNN, 其中, 每个基于自 注意力的长 短距离特征融合图神经网络SA LS‑GNN包括依次连接的1个自注 意力特征提取模 块和1个特征融合模块, 第l个SALS ‑GNN的自注意力特征提取模块与第l ‑1个SALS‑GNN的特 征融合模块相连, l=2,3,...,L; 每一个自注 意力特征提取模块由M个并联的基于多头自注 意力的不同距离的特征提取子网络SA组成, 每个特征提取子网络SA由H头自注意力模型构 成; L个SALS ‑GNN的自注意力特征提取模块结构相同、 但模型参数不同, 并且L个SALS ‑GNN的 特征融合模块结构相同、 但模型参数不同; 所有H 头自注意力模型 结构和参数均相同; 所述MRI数据预处理模块, 输入核磁共振成像仪采集的MRI影像, 并将采集的MRI影像预 处理后, 输出 大脑图结构数据, 具体包括: S11)通过核磁共振成像仪采集大脑的MRI影像, 使用标准脑模板对采集的每一幅大脑 的MRI影像进行脑区划分; S12)将进行脑区划分后的每一幅大脑的MRI影像通过预处理得到一个原始图数据G0= (N,E,F0), 其中G0为有向图, N 为节点集合, E为边集合, F0为节点特 征集合; 对于SALS ‑GNN中的自注意力特征提取模块, 除第1个SALS ‑GNN以外的任意一个SALS ‑ GNN中的自注 意力特征提取模块, 输入为上一个SALS ‑GNN中特征融合模块的输出图数据, 对 于第1个SA LS‑GNN中的自注 意力特征提取模块, 输入为MRI数据预处理模块得到的原始图数 据G0, 各SALS‑GNN用于获取大脑脑区间的长短距离依赖, 对脑区进行不同距离的特征提取, 输出不同距离的大脑特 征, 这L个SALS‑GNN的工作过程具体为: S21)将原始图数据G0=(N,E,F0)输入第1个SALS ‑GNN中的自注意力特征提取模块, 在第 l个SALS‑GNN的自注意力特征提取模块中, 输入数据为第l ‑1个SALS‑GNN的特征融合模块的 输出图数据 Gl‑1=(N,E,Fl‑1), 每一个图数据的节点集合N和边集合E都不会被更新, 由图数 据Gl‑1中N个节点特征 构成的特征矩阵 将会被更新, 其中, Rf表示长度为f的向量, f为预处 理参数, n =0,1,...,N‑1; S22)图数据Gl‑1=(N,E,Fl‑1)输入M个并联的基于多头自注意力的不同距离的特征提取 子网络SA, 每个特征提取子网络SA都具有相同的信息传递流程, 以路径长度m表示第 m个特 征提取子网络SA提取 特征的距离, 第m个特 征提取子网络SA被命名为SA ‑m, m=1,2,. ..,M; S23)任意一个子网络SA ‑m对有向图Gl‑1中的每个节点进行距离为m的特征提取, 对任意 一个节点Nj, j=0,1,...,N ‑1进行特征提取时, 选择距离d(Ni,Nj)=m的点集{Ni}的特征, 通 过第l‑1个SALS‑GNN的自注意力特征提取模块中的H头自注意力模型进行聚合, 其中i≠j, i,j=0,1,. ..,N‑1; S24)在H头自注意力模型的任意第h个抽头中, h=1,2,...,H, 每个节点的特征 通过公式 (1)的三个线性层获得对应的向量 其中 是三个不同的权重矩阵, 是与之对应的三个不同 的偏置矩阵;权 利 要 求 书 1/3 页 2 CN 114743053 A 2S25)获得所有节点的向量 后, 将S23)得到的距离d(Ni,Nj)=m的点 集{Ni}, 通过公式(2)的自注意力模型, 聚合得到节点 Nj的特征 其中, epq表示有向图Gl‑1中边NpNq的权重, p,q=0,1,...,N ‑1, 这里节点Np和Nq是相邻 的, 所以满足d(Np,Nq)=1; 距离d(Ni,Nj)=m的路径NiNj间的权重为构成路径NiNj的所有边的 权重的连乘; dK表示 的维度; Softmax( ·)为归一化指数函数; Π表示连乘符号, 上标T 表示向量的转置; Ni∈N{d(Ni,Nj)=m,i≠j}表示节点Ni到Nj距离为m的所有节点的集合, 且i ≠j; NpNq∈NiNj表示边NpNq是路径NiNj中的一条边; 是一个中间变量; eji表示节点Ni到 Nj的权值; S26)将S25)得到的H个抽头特征 按式(3)进行融合, 得到SA ‑m输出节点Nj的特征 其中Concat(·)表示为矩阵拼接; 对于SALS ‑GNN中的特征融合模块, 输入位于同一个SALS ‑GNN中的自注意力特征提取模 块获得的特 征, 通过融合, 更新大脑 脑区的特 征表达, 输出融合后的特 征, 具体包括: S31)原始图数据G0的节点集合N的特征矩阵为 将M个特征提取 子网络SA分别 得到的特征Fl,m一起输入一个特征融合模块, 通过公式(4)进行特征融合, 得 到第l个SALS ‑GNN的输出特征Fl; Fusion(·)表示特征融合模型; Fl=Fusion(Fl,1,Fl,2,...,Fl,M)              (4) S32)通过L个自注意力特征提取模块和特征融合模块的级联, 构建深度为L的基于图神 经网络和自注意力的磁共 振影像辅助处 理系统, 基于该系统得到如下 结果: 1)获得L×M×H个注意力图αl,m,h, 注意力图进行可视化得到热力图, 即可视化结果1, 热 力图反映任意网络层l在距离为m进行 特征聚合时, 脑区间的侧重倾向; 2)通过在可视化结果1中同一网络层l, 不同聚合距离m的热力图, 得到特征信息在不同 距离间的传递特性, 获得不同距离的脑区依赖关系;权 利 要 求 书 2/3 页 3 CN 114743053 A 3

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